Pour une coupe droite, il faut guider la scie sauteuse avec une règle ou bien un tasseau, qui au préalable aura été fixé avec des serre-joints.
Pour les coupes courbes, la scie sauteuse est utilisée seule en suivant le tracé préalable.
En ce qui concerne les coupes avec évidements, il suffit de percer deux trous aux deux extrémités opposées et ensuite on introduit à tour de rôle dans ces trous la lame de la scie sauteuse pour donc réaliser la découpe en deux étapes.
Enfin, pour les découpes angulaires, il faut se servir de la semelle de la scie sauteuse : la semelle de la scie est un guide qui permet d’orienter la scie sauteuse selon un angle qui peut aller de 0 à 45 degrés, ce qui diminue d’autant l’épaisseur qui peut être sciée.

De multiples matériaux, grâce à l’interchangeabilité des lames (une lame adéquate doit être utilisée fonction des matériaux), peuvent être sciés : bois et dérivés du bois (contreplaqué, aggloméré, mélaminé, latté, stratifié, etc ….), pvc, faïence, carton, polystyrène, cuir, terre cuite, etc …. On distingue par conséquent des lames pour le bois, pour les métaux, des lames à chantourner (coupe en courbe), etc …

Même si cette machine peut d’attaquer à des matériaux plus résistants comme par exemple l’acier, l’aluminium, le cuivre, le carrelage, certains verres, etc …., d’autres outils sont préférables en terme d’utilisation car plus adaptés : ainsi, la faïence peut être coupée avec une lame de scie sauteuse spéciale au carbure mais à vitesse lente et sans forcer la scie.